水质自动监测站可分为固定式、简易式、小型式和浮船式水站，是水环境监测领域中的重要一环，它可针对饮用水源地、河道、湖泊、水库等水质变化起到预警和监测作用，以便达到环保监测部门对水质变化的掌控。首先运维单位应建立覆盖人、机、料、法、环等环节的运维管理体系，保障地表水水质监测系统正常可靠的运行。运维人员应经培训合格后上岗，具有相关的专业知识，能独立完成水站的维护工作。常规参数叶绿素a、蓝绿藻密度应按照一小时为周期的频次进行监测，其他监测项目按照四小时为周期的频次进行监测，必要时可进行加密监测。运维单位应根据水站的配置、仪器性能、断面上下游污染源分布情况以及支流的汇入情况，编制水站运维的管理手册。运维单位定期制定运维计划，内容包括维护时间、维护人员、维护内容等。运维单位每月3日前提交上月的运维报告，内容包括水站的参数配置、运维人员、实际巡检日期、维护内容、维护效果等等。