摩托艇、赛艇这两类校外培训机构申请办学许可证各有其难点。

首先，摩托艇的驾驶培训难点在于，摩托艇的操控需要较高的技术水平，而且在不同的海况条件下，需要进行不同的操控技巧的练习，所以在进行培训前需要先对学员进行基本的操控技巧的训练。此外，由于海上情况的多变性，培训机构需要配备专业的教练员和救援团队，确保学员在练习过程中的安全。

其次，赛艇的驾驶培训难点在于，赛艇的操控需要更高的技术水平，包括对艇身的调整、对风向的掌握、对舵的控制等，需要学员具备较强的体能和心理素质。此外，由于赛艇运动的激烈性，培训机构需要配备专业的教练员和救援团队，确保学员在练习过程中的安全。

另外，两类培训机构的审批流程也存在一定的难点。对于摩托艇的驾驶培训，由于其操控技术要求高，需要配备专业的教练员和救援团队，因此审批流程相对较为复杂，需要进行多次的现场评估和审批。对于赛艇的驾驶培训，由于其需要的设备和场地投入较大，因此审批流程也相对较为严格，需要进行多次的现场评估和审批。

综上所述，摩托艇和赛艇这两类校外培训机构的申请办学许可证存在一定的难点，需要培训机构在设备、教练员、救援团队等方面做好充分的准备和投入，以确保学员的培训质量和安全。